Fundada em 1 de Julho de 1980 (DR, III série, nº 149) por iniciativa de Vitorino Magalhães Godinho e de um grupo de seus colaboradores e discípulos, a Associação Portuguesa de História Económica e Social (APHES) conta actualmente com mais de 300 associados, a maioria dos quais investigadores e docentes em instituições universitárias nacionais e estrangeiras. É, desde 1986, membro da Associação Internacional de História Económica.
Para prosseguir o seu principal objectivo estatutário - «contribuir para o progresso dos estudos de história económica e social» -, a APHES organizou até à data 30 Encontros científicos (28 Encontros anuais e 2 Encontros extraordinários). Com o propósito de fomentar os contactos entre os investigadores das várias universidades do país, intuito presente desde o início da actividade da Associação, a organização dos Encontros tem sido levada a cabo pelas diversas instituições universitárias a que pertencem os seus sócios, procurando-se uma alternância anual que contemple a diversidade do panorama nacional. Desta forma tem-se procurado dar a conhecer a produção historiográfica desenvolvida nas várias instituições e estimulado a discussão de tópicos centrais da historiografia nacional e internacional. A APHES tem acompanhado o objectivo de internacionalização da investigação cientifica em Portugal, tendo os seus encontros anuais vindo a contar com uma participação crescente de investigadores estrangeiros e de sessões de trabalho em língua inglesa.
Em 2001 a Associação institui o Prémio APHES visando fomentar a investigação de qualidade por parte de jovens investigadores de nacionalidade portuguesa ou a trabalhar em universidades portuguesas.